С 1919 года стоял в рядах Красной Армии. Первые шесть месяцев Якуб Абдуллович служил в Пензе, затем был отправлен в Саратов, в военный городок. Из Саратова перебросили в Москву, где служил до 1921 года в санчасти медбратом, то есть в качестве санитара и помощника врача Мурашко.